Notaildog

這是一本讓早早放棄物理的我也看得懂的物理的書！ http://phdcomics.com/noidea/

Michael Lewis did it again! Through my whole adulthood, his books have been a source of references for me to understand this irrational world. The Liar’s Poker was the primer for me before I had the firsthand experience in the deceiving culture of finance. Yes, you can make anything a security and create a illusional  market out of it. The Moneyball was the prefect guidebook to get any school kids into statistics. Everyone should read the Blindside before watching their first NFL game. The Bigshort just taught us why a person shouldn’t listen to the sales in Deutsche Bank to buy those toxic collateralized debt obligations with the US$ 20 million that he sold his company to Genentech for. Michael Lewis seems to have that story-telling magic wand to use actions of people, words of conversation, stories of stories, to translate extremely technical ideas into the yet another pager turner. He did all these by using very simple but engaging vocabulary that even I didn’t need to look in...

Single-cell Mass Cytometry的奇妙冒險 好像很久沒寫科學類的文章了， 兩週前我下決心把最近在實驗室的journal club的文章拿來回收寫寫科普， 好像寫到最後變得落落長又不夠普及， 不過現代的科學研究文章就是這樣冗長啦， 就加減看看吧。 要講的是這篇Cell: Systemic Immunity Is Required for Effective Cancer Immunotherapy 先說科普上的結論： 系統性的免疫反應也是跟抗癌是很有關的！

人類短暫的同理心真的可以因為跟有這樣背景的人接觸，而長期影響觀感嗎？換句話說，在各種社會接受度的對立議題上，究竟要怎麼樣的經驗才能改變一個人的觀點呢？拿同性戀的接受度來說，時有耳聞原本對同性戀抱持非常負面態度的人，因為家族中或是好友中有人出櫃了，而完全改觀的。但是畢竟不是人人都有第一手親朋好友出櫃的經驗的，那到底我們要怎麼解釋過去十年來人們對同性戀支持度有這麼大的改變呢？還是說，短暫地接觸就可以產生這樣的說服效果呢？如果是這樣，是否一定要跟當事人接觸才會產生同理心呢？對許多當下激烈衝突的議題，同性戀，變性者，墮胎等等，，不僅是社會心理學家會好奇人們怎麼改變對這些議題的負面態度，許多社會運動者也更想知道怎麼更有效率地說服大眾。

浩鼎延燒至今真是令人傷心，這篇文章原本只發在ＦＢ上，但是基於分散風險原則還是也放在這好了，儼然一副還會有人在乎的樣子。 這篇文章原本寫的目的僅在說明生物科技跟利益衝突不可分離的現實面。其他道德法律問題許多網路名嘴才是專家，我就不便評論了（反之不然的樣子）。

亂評 Exposure to ideologically diverse news and opinion on Facebook Eytan Bakshy , Solomon Messing , & Lada A. Adamic 這期的Science刊出了由Facebook 的data analyst in-house分析FB使用者政治傾向的研究，分析究竟在美國一千萬名的FB使用者，是否會因為使用FB，而被FB的針對使用者行為而投其所好的社群演算法(social algorithum)，而使使用者因為常點選偏自由派或保守派的政治相關訊息新聞，盡而更常在個人網頁上看到這類投其所好的訊息新聞，讓使用者以為整個社群的政治傾向都偏好如此，造成所謂Filter bubble的效應。

”其實人類已經吃轉殖不同生物基因的GMO幾千年了“ The genome of cultivated sweet potato contains Agrobacterium T-DNAs with expressed genes: An example of a naturally transgenic food crop   讀書心得   (從FB備份)  

你是小麥系還是稻米系？

這是我之前發表在PTT 咖啡版上， 真對一篇不科學的科學新聞替版友解釋的文章， 一樣陰險地用來灌水... (最近太忙了，每天都要喝一攤)

2012年12月號的Nature Chemical Biology， 刊登了讓glycobiologists振奮的兩篇competing articles， 一篇來自Harvard Medical School的Suzanne Walker lab， co-first authors: Michael Lazarus & Jiaoyang Jiang http://www.nature.com/nchembio/journal/v8/n12/abs/nchembio.1109.html 另一篇來自University  of Dundee的Daan van Aalten lab co-first authors: Marianne Schimpl, Xiaowei Zheng, & Vladimir S Borodkin http://www.nature.com/nchembio/journal/v8/n12/abs/nchembio.1108.html 兩篇各自解開了human O-linked beta-N-acetyl-glucosamine tranferase (OGT)跟sbustrate peptide以及UDP-GlcNAc的ternary structure， 為OGT催化protein O-GlcNacylation的機制提供了解答 (或是更多的問題)

就在本人如火如荼地準備資格考的同時， 兩個我把他們視為競爭者但是他們眼裡大概沒有我的lab， 不約而同地在這兩個星期各發了一篇跟我現在做的跟以後想做的有關的paper。 在我個人自滿於我的想法是正確的同時， 醣類合成的領域也已經進入了百家爭鳴的時代也說不定?!

如果有人以為我要講Nobel就大錯特錯了， 因為immunology雖然我一直很有興趣卻從來不曾認真學習過， 所以不便多說。 今年Albert Lasker basic science得主是Yale的Art Horwich跟Max Planck的Ulrich Hartl， 以發現chaperone的功能而得獎。

雖然忙著學做yeast genetics (其實還是在做protein) 但是我還是決定要在這個單元下新開一個連載: Taiwanese in ChemiBio 不定期更新台灣科學家在ChemBio上的研究 當然，會讓我突然這麼想做的原因 就是因為最近的Nature Chemical Biology登了兩篇台灣的學者做的研究: 第一篇是中研院分生所袁小琀老師實驗室發的: Structural basis for RNA trimming by RNase T in stable RNA 3′-end maturation 這個lab...總是很常跟人聊起但是其實我完全沒有關係 (阿...我是有間接地推.....薦該實驗室的某人入.......一個實驗室沒錯) 至於這篇在講甚麼...自己看吧哈哈哈

剛剛在PTT Chemistry板上回答Beer's Law測protein concentration的問題: 基本上用Beer's Law來測蛋白質濃度大概都是依據這篇paper: Gill, S.C. and von Hippel, P.H. 1989. Calculation of protein extinction coefficients from amino acid sequence data. Anal. Biochem. 182:319-326.

今日科學單字: Allosteric effect Google translate: 變構 My translate: 隔山打牛 (賭俠2之上海灘賭聖~~~) Yeah~

因為lab正在清-80度冰箱 加上外面天氣鳥到不行(嚴然只是正常的冬天天氣) 所以原本打定主意要狂做實驗的我變成只好狂在宿舍打混 繼續朝著把我的blog轉型成為超 人氣 nerdy blog的目標前進 (原本就夠nerdy了~) 延續上一篇 繼續讓我紀錄一下在UCSF兩個學季下來更多的感想 這篇的題目是Chemical Biology 話說我在大學就誤打誤撞加入了一個化學家主持的實驗室 所以一直以來就對Chemical Biology這個領域有點熟又不會太熟 (會用這個句型的人應該都老了) 後來毅然決然下海學做化學合成後才慢慢決定往這個領域走 但是這個領域的定義卻很難跟人解釋 大部分的人，包括一般念生科的問我在研究甚麼的時候 聽到化學生物學往往就會說 "喔~生物化學嘛" (維大力，義大利?) 所以我也就懶得解釋了 我都跟人說我在做食品科學 反正糖/醣傻傻分不清 (自暴自棄~) (我也是因此逃過拿AIT黃單的命運!)

鏘鏘鏘~~恐怖的冬季終於過去了 並不是因為SF的冬天比夏天還熱 也不是今年居然下了34年來的第一場雪 (而且還是在38oF時候下的,果真是春雪了無痕~) 而是終於結束了課業最重的這一季~ 雖然只有的兩門課: chemical biology, reaction mechanism 但是每一門都是要你命三千般地辛苦 當然...辛苦歸辛苦，個人覺得還是蠻有收穫的 每個星期都有一堆大咖來演講著實令人收穫豐富 更不用說我們的老師們也是一堆大咖還要花時間給我們幾個死小孩上課啦哈哈哈 但是個人覺得學到最多的是一些無形的能力 或著可以說是抽象的執行面的東西 像是敝校很注重的presentation detail 雖然以前的seminar也很硬 老師很愛電人 (就是你，林丁丁!!!!!!) 不過說真的也從來沒有人真正注意表達以及跟聽眾的互動 大家似乎也只在乎投影片多不多 著墨於過多細節的結果就是聽眾很容易就分心了 實在是本末倒置 結果就是大家一個星期要花快四個小時跟四十個人枯坐在教室 不是發呆就是睡覺 (我想睡覺多一點~) 只能說無效的演講不如不要講! 但是在我大學受的教育中又有多少老師有在教這種東西咧... 真是令人想都不敢想...@_@ 寫這篇的用意其實是... 有人最近說我的中文寫作表達能力遠遜於英文 我只能說...從小到大我不認為有真的上過甚麼中文文法或是寫作表達課程 我只會背書 英文文法我倒是比較熟 我的proposal也是不錯易懂的!!!! 所以就是這樣!!!! HHMI is only asking for English proposal~!!!!